Tienes unos desviamientos de 32dB entre pico y valle: Mi sugerimiento es que empieces por colocar mejor el sub. Cuando obtengas mejor respuesta de partida veremos por donde empezar.
Para ecualizar tienes que mostrar siempre caja derecha + sub por un lado y caja izquierda + sub por el otro... pues ambos interaccionan y hay que ecualizar sobre la respuesta suma que nos llega de cada canal (caja principal + sub) al punto de escucha
Un saludete