Puedes conectar los Bose frontales a las salidas A del ampli (L,R) y el resto a las conexiones de central y surround.

Aparte puedes conectar un par de altavoces más (de estantería, columna o como más te gusten) a las salidas B frontales, de manera que luego podrás conmutar entre escuchar los altavoces A (satélites Bose) o B (los "Buenos")

Yo los tengo así en mi casa paterna y para mi gusto no están nada mal los bose para ver pelis. Otra cuestión es si encuentras cosas mejores por menos precio, etc... eso ya es cuestión de cada uno. Pero tampoco te creas que les puedes pedir grandes cosas en hi-fi a unos satélites.

Y en cuanto a la calibración no tendrás problemas, porque si no me equivoco esta se hace mediante un micro, así que da lo mismo si los altavoces se conectan al sub o si incluso van sin cables.

Saludos.