Cada vez que midas con el REW desactivas el APO primero, y los filtros que te de el REW se los pones al APO y entonces lo activas.

Sí mides con el APO activado los filtros que te de el REW te servirían siempre y cuando los añadas a los ya existentes en el APO.... Pero entiendo (yo no uso APO), que lo suyo es lo que te digo al principio...luego puedes ajustar metiendo filtros manualmente.