No debes usar el modo Direct porque necesitas el Bass-management del AVR. Tienes que medir todos los altavoces con el Bass-management aplicado en el AVR, es decir, altavoces en Small y el crossover que selecciones y LPF para LFE en 120 hz. Después no lo puedes cambiar porque la EQ sólo valdrá para esta confguración.
Si mides en modo Direct, es decir, sin Bass-management (que sería altavoces en Large y el sub por otro lado) o bien después de ecualizar escuchas así con esa configuración (lo cual no es recomendable) o bien aplicas un Bass-management en APO antes de la EQ lo cual complicaría muchísimo todo, habría que mezclar canales, aplicar crossovers y también los 10 dB de ganancia al canal LFE.