Es lo mismo en cuanto a pixeles finales, pero por lo visto es recomendable que sean SBS OU en el caso de las pasivas como la LG. Todo viene de la distribución simultánea de imágenes a los dos ojos, que se hace dividiendo las líneas al 50 % para cada ojo. Entonces es algo así:
Una Full SBS (división vertical) tendría una resolución de 3840*1080, que serían 1920*1080 para cada ojo pero en el caso de las pasivas 1920*540.
Por otro lado las Full SBS OU (división horizontal) sería 1920*2160 que al dividir la pantalla son 1920*1080 y en el caso de las pasivas 960*1080.
El nº de píxeles es el mismo pero parece que la relación es mejor en el caso de los SBS OU al mantener los 1080. Todo esto es en teoría, seguro que en la práctica no se aprecia

Esto es RESOLUCION en cuanto al HD, pero sigo sin encontrar nadie que me aclare lo del EFECTO 3D. Influye o no el tipo de 3D (full, digamos, como el de un Blu-Ray o un ripeo SBS)?