Ya lo he conseguido arreglar, con el mkvmerge modifico la resolucion, pongo sbs y le quito el parametro .mk3d y le pongo mkv y ya las reproduce. pero solo si son mkv, si son 3d pero en formato xvid no los puedo reproducir como 3d. Sabeis algun programa para pasar de xvid a mkv? yo es que tengo alguno pero no me permite esa funcion o no lo hace bien.

Muchas gracias por la respuesta.