Con los mkv todavía no he tenido ningún problema, los carga rápido y no se me ha colgado la tele en ningún momento. Ayer probé un mkv en 3D que eran 15 Gb de archivo y perfecto.
Haciendo comprobaciones los archivos que me dan problemas son los .avi grabados con el codec divx. Suelen ser los que menos espacio ocupan 700-800MB. Los .avi grabados con el codec xvid me los lee sin problemas que normalmente suelen ser los que ocupan 1,2-1,5 GB.
Te dejo la información de uno que no lee (la primera imagen) y otro que si.