Por fin pude hacer la prueba también con uno de los archivos de Riswill. Me pasa lo mismo con el firm 6.0.5 y ahora todavía estoy más seguro de que el tema viene de lo que comentamos del flag en la cabecera del archivo. Al identificar el archivo cómo 3D, el televisor pasa automáticamente a 3D, pero con esos archivos solo da la opción de 3D/2D y ya no se pueden invertir. Bueno, hay una opción un poco chapuza que es ponerse las gafas del revés.Así se invierten los lados y cada ojo ve el lado correcto.
Lo único que se me ocurre es que con algún editor de video se deben poder modificar esos flags. Probablemente incluso decirle si el archivo es 3D lado-lado, arriba-abajo o invertido y entonces debería funcionar bien.
Saludos!