Hola ubik1,

Cualqueira de los dos cumplirá con las necesidades que tienes, pero yo no compraría un A6.

Si quieres algo de bajo consumo y buen precio, un Athlon en AM1 me parece muy buena opción, y si quieres algo más duradero, yo te recomendaría "dar el salto" a un A8 en lugar de un A6. La diferencia de precio no será mucha, el consumo será similar, pero el rendimiento claramente mejor, puesto que tanto los A6 como los A4 llevan un solo módulo (vendidos como dual core) mientras que los A8 llevan dos módulos (vendidos como quad core)

En cuanto a las placas FM2+ que pones, obviamente la segunda es mejor, pero no por ello mejor opción. La única difernecia que notarás en la práctica es la diferencia de conectividad entre ellas, con lo que tienes que valorar si usarás ese "extra" y si merece la pena pagar por él. La FM2A88X-ITX+ lleva wifi, un eSata, dos USB 2.0 más y soporte de Raid 5 como principales diferencias. Puedes ver aquí una tabla comparativa: ENLACE

Saludos