Creo que no necesitas preocuparte por un DAC, en principio, pues el Yamaha ya tiene un buen DAC que soporta perfectamente incluso el Hi-Res de Qobuz: 24 bit/192 Hz.
Osea, conectando el HTPC por HDMI al Yamaha y enviando imagen y sonido estereo ya tienes la calidad de audio necesaria, al nivel del Yamaha con su DAC y amplificacion. Muy buena calidad.
Puedes probar los modos 'purect direct' o 'straight' para escuchar la musica sin los filtros y tratamientos digitales, mas nitida y parecida al sonido de un estereo, aunque puede que te guste menos.
De hecho conectandolo como comentas con el SB E5 no ganas nada, no hace de DAC sino solo de transporte ya que el audio entra y sale en digital. Es el Yamaha igualmente el que hace la conversion analogica, igual que por hdmi pero por otro camino.
En todo caso necesitarias un DAC con salidas analogicas, como el topping E30, y conectar estas a las entradas analogicas del yahama o de cualquier amplificador. Ahora, no se si ibas a notar diferencia respecto al DAC del yamaha. No se si vale la pena invertir en eso.
En ese caso, deberias poder enviar el video a la salida HDMI y el audio al DAC por USB.
Edito: En el lado del Yamaha, como comentas, al ser el mismo aparato no se si permite ambos a la vez. Pero diria que si que se puede.