MrOrange.
Es imprescindible entender los conceptos que mecionas para saber lo que estás haciendo, y ahora lo tengo todo más claro, ahora bien desgraciadamento asimilados estos no tienes la solución para todos los problemas sino el conocimiento para saber para donde tirar y dónde buscar el problema.
Una vez leido tu explicación veo que no puede haber un manual universal, sino más bien un manual para XBMC con un SO concreto con una conexión concreta al ampli, un manual para MediaCenter con por ejemplo Windows 7 y SPDIF, un manual para Media Classic concreto con un pack de filters que funcionen... Sería bueno que la gente expusiera la configuración que tiene si esta es satisfactoria para su entorno.