Hola Ruben,

Yo la semana pasada estuve afinando la distribución adaptada de Linux que ponemos en los HTPCs que vendemos y me pasó algo parecido.

El problema era como si la mitad superior de la pantalla y la inferior tuvieran un desfase de x fotogramas, lo cual daba un efecto horroroso. La solución fue activar en el panel de linux el "vsync" (sincronización vertical). Lo raro es que a ti te pase en Windows.

¿Con que software has probado? Te recomendaría descargar la versión de Intel de OpenElec e instalarla en un pendrive para probar, así sabrías sin dudas que es problema de software, pues estas distribuciones son prácticamente un XBMC autoarrancable que viene ya configurado para cada plataforma.

Saludos