Salida SPDIF deshabilitada

Comentas que tienes conectada el PC por SPDIF óptico al Yamaha y oyes 5.1
Pero lo oyes haciendo passthrough de la señal 5.1 AC3 (DD) o DTS? He de suponer que sí. Se te ilumina el logo DTS o DD en el Yamaha al poner una peli 5.1?

Si no se te ilumina el logo, lo que estarás pasando es 2.0 (estereo) en LPCM por el SPDIF y el Yamaha simula un 5.1 con el Dolby Prologic...

Si tienes un 5.1 en pass-through de AC3 y DTS, puede ser (la verdad es que nunca lo he comprobado) que la señal, al mandarse inalterada y comprimida del PC al Yamaha, no puedas cambiar volumen ni ecualización.
Es un tema curioso que no he comprobado, pero que tiene su lógica. Aunque podría que estuviese equivocado.

De todas formas mira que tengas bien configurado el panel de control en el apartado de dispositivos de sonido y tengas habilitada y configurada la salida SPDIF bien y ver si en el AC3Filter tienes habilitado el pass-thought

Saludos