Vamos a ver si soy capaz de explicarme. Todos los sistemas son manipulables y nada es absolutamente infalible pero en un proceso con mesas electorales donde existen representantes (apoderados) de todos los partidos donde controlan el proceso y corroboran que el contaje manual de los votos se corresponde con lo que ha sucedido en la jornada electoral ANTES de introducirlos en un sistema informático permite que exista una constancia "real" de la votación. Cada acta permite saber que los datos (que son accesibles por los representantes de los partidos en el sistema informático) se corresponden con las actas que previamente han firmado mesa a mesa y por distrito electoral de una forma relativamente rápida y sencilla.
Si el proceso es completamente informatizado donde nadie sabe ni en que condiciones se ha hecho el voto ni como llega hasta el sistema informático y como se registra todo queda a la bondad e inviolabilidad del sistema. Podrías decir que esto es similar a lo que sucede hoy en día con el ordenador de hacienda o con las transacciones y compras electrónicas que se producen a millones diariamente en el mundo. La diferencia es que aquí es cada persona la que tiene la obligación y precaución de comprobar que sus transacciones se corresponden con los cargos efectuados.
Saludos