Tienes que conectar los altavoces frontal, laterales y traseros a las salidas del ampli, y el subwofer a la salida pre out para subwofer del ampli, que supongo que tiene, de esta manera se tienen que escuchar todos, si no es así es porque hay alguna conexion mal hecha o la conficuracion del ampli no esta bien.

Las salidas que tiene el subwofer son para que este discrimine la señal cuando el ampli no tiene salida pre out para el subwofer o simplemente tiene una salida estereo, entonces se conecta esta al subwofer y el discrimina y distribuye para los satelites y las bajas frecuencias se emiten por este subwofer. Prueba a ver y si no especifica el modelo de ampli que tienes o las salidas de altavoces que tienes para q te podamos ayudar mejor.