Hola.
Por partes:
Que son las salidas av ?? Supongamos que llamas salidas av a las RCA.
Para conectar un CD a un ampli, puesto que la señal es estéreo, utiliza las salidas RCA, blanca-roja.
Efectivamente los amplis se calientan, y lo que es peor, si pones el CD encima seguro que tapas rejillas de ventilación del ampli. Si tu receptor no tiene encima rejillas, entonces podrías ponerlo, porque tampoco creo que vaya a ser una sartén para el CD. Vamos que me preocuparía mas el sobrecalentamiento del receptor que del CD.
Si el ordenador tiene una salida óptica utiliza esta, porque es la única manera de que tengas 5.1. Efectivamente por jack sólo tendrás estéreo y la "triple" salida entiendo que es rojo, blanco (para audio estereo) y amarillo para video, así que estamos en las mismas.
El subwoofer. La salida del ampli con un sólo cable coaxial, como lo tienes, a una entrada del subwoofer. Suelen recomendar la roja, pero suele dar igual, salvo que venga indicado en el manual o en el altavoz. El selector en LFE, correcto. El botón de fase sólo si realmente fuera necesario porque tuvieras problemas con los altavoces o pusieras otro subwoofer, pero no te afectará.
El crossover. Es un filtro que fija a partir de que frecuencias trabaja el subwoofer. Normalmente se suele poner a 80hz. De esta manera todo lo que esté por debajo se queda en el subwoofer y el resto lo ignora. Normalmente este crossover está en el receptor. Si en el ampli ya has puesto que todas las frecuencias por debajo de 80hz vayan al subwoofer, da igual lo que pongas en el subwoofer. Ponlo a tope, porque es el ampli el que manda las señales. Bueno además de las señales que vayan a ir a los altavoces por debajos de 80hz también mandará todo lo que salga por el canal LFE en las grabaciones 5.1 ( ese es el canal .1 ).
Conexiones de consolas. Todas por hdmi al receptor y del receptor un cable a la tele. Las salidas hdmi llevan además de la imagen el sonido multicanal, y no has dicho que receptor tienes, pero lo normal es que tenga los hdmi pass through. Osea que aunque no tengas encendido el ampli, la señal llega a la tele. Ventajas? La consola ya te da la imagen escalada, y si no te lo hará el ampli, que para eso es AV. Te quitas de en medio un monton de cables porque cada hdmi lleva audio y video.
Y creo que mas o menos ya está.
Espero que te sirva de ayuda.
Saludos