Hoy por hoy no. No por falta de capacidad sino porque el formato no especifica ese framerate, no sería un blu-ray estandar.
En un MKV puedes meter video 3D 4K a 48fps sin ningún problema y reproducirlo en un HTPC si es lo suficientemente potente.
Algunos si están preparados, en los de mi ciudad informan de en que salas es 3D normal y 3D HFR (golem la morea > Pgina principal)
Sacaran el Blu-ray a 24fps. de toda la vida mientras no haya otra cosa.
No se si habrá gráficas que saquen 48fps, yo he reproducido el trailer a 48fps. (interpolado) que circula y el XBMC me lo ha sacado a 50fps. y no aprecié judder, sería el equivalente a reproducir 24fps a 25fps, lo que se ha hecho toda la vida con los DVD PAL vamos.