El tema de archivos no compatibles está a la orden del día,no te preocupes que no va a ser problema de la tele y tampoco creo que sea del disco duro.Entra en el menú de tu TV y configurala adecuadamente para que puedas obtener los mejores resultados con cualquiera de las fuentes,esto sucede mucho y es la mayor causa de que no puedas manejar satisfactoriamente tus archivos(MKV).De todos modos entra en la sala de Pantallas y busca tu modelo,es muy probable que ahí encuentres solución.Un saludo