Vuelve a amplificarlas de manera normal.
Hay algo en los filtros de las Pulsar que no va bien.... o esta creado a posta para sacar cierto sonido en ellas cuando se Bi-amplifican. Yo en tu caso las dejaría normal ya que la diferencia es a penas apreciable y encima en tu caso van peor. Mandame unas gráficas con las nuevas Pulsar, con y sin Audyssey... antes calibralo.
PD: Mejor déjalas amplificadas normal.