Desacoplar mecánicamente un altavoz no es cuestión a tomar a la ligera, una resonancia de la caja en sí alterará la respuesta que percibamos, por ello se emplean soportes específicos, para evitar esas posibles vibraciones (no quiere decir que mejoremos el sonido, sino que evitamos empeorarlo en caso que resuenen cajas y/o soportes.

Un subwoofer, por la energía y frecuencia que generan, es una fuente de vibraciones, por tanto sería el último y peor sitio a considerar para colocar otra caja sobre el mismo.

No obstante, si no te queda más remedio, deberás minimizar las posibles vibraciones entre ambos, una buena solución en este caso es amortiguar como te han apuntado (reducir en tiempo y amplitud posibles vibraciones que se transmitan entre ellas), y si por medio añades masa para bajar la frecuencia de resonancia del elemento que interpongas, mejor aun: hazte con alguna base pesada (losa de granito o similar), ponle tres gotas de silicona en la base, apoyas esta sobre tu sub, sobre esta base pones otro absorbente (tipo lo que te han indicado en el enlace, o cualquier elastómero, tipo espumas, gomas, caucho) y sobre este finalmente tu altavoz. Haz la prueba y si te satisface, no es lo ideal pero tendrás una solución de compromiso aceptable.

Saludos.