Si te deja los frontales en Largue, entonces el subwoofer no está emitiendo las frecuencias bajas de esos canales, las emiten los altavoces frontales. Puedes hacer dos cosas si quieres que sea el sub el que las emita: Pones los frontales en Small y su corte en 60 u 80 hz (no te debería borrar la configuración de Audyssey) o los dejas en Largue y activas la función Extra Bass para que tanto los frontales como el subwoofer te saquen las frecuencias bajas.