Hola, en tu antiguo Yamaha tenías una salida dedicada para el subwoofer y efectivamente era mono ya que englobada los dos canales.
En tu nuevo Musical Fidelity vas a usar las salidas pre out y cada una corresponde a un canal por lo que si solo conectas una salida perderás la otra.

En este caso debes conectar las dos salidas a las dos entradas del subwoofer.
Otra forma sería conectar el subwoofer por alta desde la salida B de altavoces.

Si alguna vez vas a usar dos subwoofers, debes emplear un cable para cada uno desde cada salida.
Puede ser en Y o con dos RCA en cada extremo.

Espero haber aclarado algo.
Saludos.