Empezamos por el final. Sí, son 14 días "naturales", cambiaron la ley hace un año. Mira el artículo 71 del BOE que publica la Ley 3/2014 del 27 de Marzo:

BOE.es - Documento BOE-A-2014-3329

"Se modifica el artículo 71, que queda redactado del siguiente modo:
«Artículo 71. Plazo para el ejercicio del derecho de desistimiento.

1. El consumidor y usuario dispondrá de un plazo mínimo de catorce días naturales para ejercer el derecho de desistimiento."

Seguimos con la calibración. A ver, tampoco puedes pedir mucho a una calibración automática. Está ahí para usuarios que no tienen ni idea de como empezar, y al 90% de ellos les vale con eso... muchos ni la pasarán, seguro. Pero, los que somos un poco más puntillosos necesitamos afinar el sonido y eso solo se consigue a mano.

Si el YPAO te ha detectado error en la fase de un altavoz, si no es porque lo tienes mal conectado, seguramente será por alguna cancelación o alguna reflexión, o algo por lo que el considera que cambiando la fase se obtiene mejor respuesta. Prueba a cambiar la conexión y a ver que tal... no pasa nada por hacer esto.

Yamaha trata al subwoofer de una manera muy especial. Para nada te lo va a calibrar para que te inunde la sala de graves potentes, lo calibra para que tengas un grave profundo y extenso, pero sin que sea muy notable... es decir, si lo quieres más presente lo tendrás que subir la ganancia en el canal. A mi el YPAO me dajaba la ganancia del sub en -10db y lo terminé subiendo manualmente a 0db. Cómo va mejor? para Yamaha más atenuado, para mí con más ganancia. Al final son gustos y formas de valorar el sonido.