Ponlo donde mejor suene el subwoofer, o ya de perdida en donde no estorbe, no hay una regla para colocarlo. Una ventaja del subwoofer es que no importa donde lo pongas, nunca sabrás de dónde viene el sonido.

Ya sea que lo pongas, atrás, en frente, al lado, etc, etc, el sonido siempre parecerá que viene del centro, o en algunos casos de alguna bocina en especial.

En otras palabras, no afecta al sonido la ubicación del sub.

Sí afecta siempre y cuando si en la posición en la que está suena débil, pero al cambiarlo de lugar se corrige el problema y lissttooooo.

PD: En mí caso yo lo tengo tal y como lo tienes colocado tú.