Para ver como están los graves realmente habría que medir externamente. Audyssey aplica esos recortes porque seguramente en esas zonas hay unos picos considerables en la respuesta. Yo lo veo normal porque esas cajas dependiendo de la sala y su ubicación es muy probable que tengan los bajos pasados.
El subwoofer no tiene por qué sonar más "lento" el problema suele estar en la optimización. Yo tengo mis columnas cortadas en 85 hz y muy bien un grave muy limpio.