Es posible actualizar la versión HDMI 1.3 a 1.4, respecto a las caracterísiticas del aumento de ancho de banda, de hecho Harman Kardon lo ha hecho con algunos modelos.

Por lo que se no hay un firmware que haga eso en este Pioneer, pero yo se lo preguntaría al fabricante.

Por otro lado, comprueba que el problema es del AVR, conectando directamente el lector BR al TV y comprobando que así no se producen problemas con el paso de esa señal 3D.