Hola. Veo que llego tarde al hilo, pero aun así intentaré entrar en ello.
Deduzco que quieres conectar desde un lado a otro un pc (imagen, usb y ethernet), un bluray, y a otra zona unos altavoces de zona 2. Todos los cables salen o llegan del receptor Yamaha.
Voy mal?

En el tema de los cables largos siempre hay riesgo de pérdida de señal, aunque para muchos casos hay amplificadores/repetidores. Desde luego, en los casos de hdmi, dvi, vga y usb los hay (todavía no he visto de usb3).
Si el objetivo es manejar el pc a distáncia vas por buen camino, pero si era por acceder a directorios concretos para visualizar algo de ellos, te diré que estás matando moscas a cañonazos (en ese caso bastaba con el cable ehernet y un reproductor barato de red).

En cuanto al switch ethernet (que no hub, que ya no hay, o no deberían) no hay problema en sacar las tomas que quieras desde una), pero no desaparece el efecto de cuello de botella, aunque en aplicaciones domésticas casi no se note.

Quizás un par de fotos nos ayuden a imaginar mejor lo que intentas .