Tienes razón rologa, pero hay que poner lel mismo nombre, sin ni siquiera la extensión .srt, pues el archivo ya se reconoce como srt y al ser archivos de diferente fortmato (Mkv y srt), la carpeta los admite a los dos con exactamente el mismo nombre, Ahí estaba mi equivocación pues pensaba que windows no iba a admitir dos archivos con el mismo nombre, hasta que los renopmbré idénticos y aparecieron los subt.
Agradecido.
Un saludo