Para tener una sóla biblioteca es muy fácil, es la opción por defecto del yaDIS. Lo único que tienes que hacer es tener todos los discos accesibles al iniciar el yaDIS y claro declararlos como fuentes de películas o series en la configuración. Mientras los discos estén accesibles en el momento que enciendes el Dune, desde el yaDIS los encontrará sin problemas. Eso sí, que no cambie la ubicación, porque si un disco se corresponde digamos con la letra e: y luego pasa a ser g: pues entonces no encontrará los contenidos que estuvieran referenciados cuando tenía la letra e:.
Para exportar el yaDIS lo mejor es hacerlo sobre un pincho usb conectado al Dune o sobre un tarjeta de memoria, de esta manera el yaDIS puede acceder facilmente a todo el contenido. Si lo sueles exportar a uno de los discos duros, si los conectas vía samba tienes un problema a la hora de reproducir contenidos de otra fuente samba (es decir, otra unidad) ya que una de las limitaciones del Dune es que sólo puede tener una conexión samba abierta (que seria la del yaDIS). Por eso mejor exportar a un pincho usb y olvidarse de problemas.
Espero haberte aclarado algo.
Un saludo.