Uffffff, pues como te dice el compañero Rafael, no es nada normal que tarde tanto tiempo.
Yo en tu lugar intentaría hacer un volcado de datos a otro disco duro y lo formatearía en NTFS.
Además, si lo tienes en FAT32 puede llegar a darte problemas con archivos grandes (mas de 4Gb) de hecho no te los admitirá.
Otro motivo puede ser la cantidad de espacio libre que te quede en el disco duro. Si no es demasiado el programa de desfragmentación tiene que hacer un mayor número de "movimientos" de fragmentos de archivos pero, aún en ese caso, me parece excesivo una semana.
Lo dicho, prueba a salvar datos y formatear el disco duro. Suele ser la solución para más problemas de los que nos imaginamos.
Saludos y ya nos cuentas que tal te ha ido.