Y si empiezas de 0 ? . No tiene porque cambiarte nada por haber cambiado de AV pero así te aseguras . Además, ya tienes cierta experiencia y vas a tardar un momento . Así partes de los 2 SUBS con EQ .

En resumen y si no me equivoco:

1- Ecualizar los 2 SUBS por separado.
2- Conseguir una respuesta lineal con los 2 subs conjuntamente utilizando la fase,colocación, filtros,etc.. de tu inukeDSP .
3- Obtener gráfica de Frontal Izquierdo + 2 SUBS para ver el punto de cruce entre ambos.
4- Obtener gráfica de Frontal Derecho + 2 SUBS para ver el punto de cruce entre ambos.

Una vez llegado aquí tendríamos un 2.2 optimizado.

5- Con la interconexiones de cables, FBQ etc.,, definítivas se procede a extraer gráficas del central + 2 SUBS para su analísis.

Bueno, esto es simplemente una idea , tu decides ! .

Saludos.