Hola, cada marca suele especificar en el manual como poner los valores antes de calibrar.
Lo normal es poner el volumen del sub en la mitad y si se puede ajustar el crossover ponerlo al maximo.
El volumen del ampli no es necesario ajustarlo a un valor antes de calibrar. Estoy suponiendo que haces el calibrado auto.

Despues de hacer el calibrado automatico puedes ajustar a tu gusto desde el menu del ampli los altavoces y el sub.

saludos