Idealmente lo mejor es el menor recorrido posible y la menor resistencia, luego cable lo más corto y directo entre la salida de etapa y el filtro de las cajas, pero esto es poco práctico.

En general las bananas son prescindibles, es cierto, solo se utilizan por estética del cable acabado y practicidad si se conecta/desconecta con frecuencia.

En cualquier caso lo recomendable siempre es una conexión firme y evitar el deterioro del hilo conductor. Si empleas bananas, de buena calidad y donde su tornillería apriete bien y cubra el cable, y a su vez haga contacto firme en los bornes correspondientes (esto no quiere decir caro, pero generalmete las muy económicas sí suelen ser malas en este sentido... aunque las hay caras que igualmente lo son, me viene a la cabeza las bananas que traen de serie los cables MIT, para lo que cuestan son una... basura). Si quieres dejar el cable pelado, te ahorras las bananas, solo un par de consejos; pela lo justo para que haga un buen contacto y no expongas más cable del necesario, estaña ese extremo y evitas exponer el conductor, que se deshilache y que haga un contacto firme, y aprieta bien las conexiones, incluso revisar de vez en cuando.

Con esto no debes tener ningún problema y te saldrán más económicos los cables.

Saludos.