Lo mas sencillo y coherente , teniendo en cuenta del hardware que estamos hablando, seria conectar cable desde conector 3.5 verde de la tarjeta de sonido del PC, hasta la entrada RCA de la minicadena y sin mas zarandajas
Si de ese modo, te emite un zumbido, tienes un problema con el cable o con la conexión en algun punto. Yo lo revisaria porque no deberia producir zumbidos ni parasitos acusticos.