No entiendo muy bien qué quieres decir . Me parece haber entendido que tienes dos entradas de línea, una de dos canales y otra de uno ¿no? Y luego, no sé a qué te refieres con eso de modulador de frecuencia ¿te refieres al corte o al volumen?

En cualquier caso, me imagino que lo que pasa es lo que sigue . Que si conectas en la entrada llamemos MONO, no te deja actuar porque el SUB entiende dos cosas : que tanto el punto de corte como el nivel de volumen lo hace el ampli y que entonces el sub evita esos circuitos con el fin de dar más calidad . En cambio, cuando lo haces por la entrada de línea R y L el sub debe de entender que ése trabajo le compete a él y por eso te deja hacerlo .

Pues yo pondría la que a ti más te guste . Si puedes ajustar todo en el ampli (nivel y corte) yo lo enchufaría a la entrada mono porque tienes menos circuitos y en teoría tendrás mayor calidad . Pero si con el ampli no consigues ajustar el punto que te gusta, usa la otra .

En algunos Sub, a veces, complementando el corte del ampli con el del sub a unos 5 o 10 Hz más se consigue una pendiente más suave de frecuencia . Es cuestión, como casi siempre en esto, de probar.