Vale . Si el problema que es que el canal izquierdo suena más alto pero cuando cambias las cajas al derecho el problema pasa al derecho, podemos concluir que no es el ampli, sino algo desde la borna del ampli a la caja . Por eso te decía lo de la polaridad pero si dices que está bien ...

¿Qué cajas son? ¿Tienen algún tipo de control o botón que permite variar algo su sonido? Mira a ver por ahí. Porque lo que sí me parecería raro es que las cajas suenen distintas salvo que tengan algún problema .