Supongamos que el ampli estuviera mal y los altavoces bien .

El problema es que te suena más alto un canal que el otro . Supongamos, punto de partida inicial, que el L suena más alto que el R pues porque el ampli tiene un problema . Bien, pues SIEMPRE sonaría más alto el canal L que el R, es decir, si cambias las cajas al ampli eso no le afectaría.

Pero tú dices que cuando cambias las cajas el problema se invierte, luego entonces estoy seguro que el problema está en las cajas o que no lo estás conectando debidamente pero así a distancia me es difícil saberlo . Prueba sólo conectando los frontales (2 cajas) .

Verifica dado que, según dices, tienes un botoncito de polaridad en las cajas que tienen todos la misma, o sea, que están en fase . TODAS LAS CAJAS DEBEN DE IR IGUAL .
Verifica que suenan todos y cada uno de los transductores .
Si todo está bien y sigues teniendo el problema, y si alternas la L a L R y el problema cambioa de canal, es seguro que una caja no es igual a la otra por algún defecto (en el filtro o vete a saber). Si resulta que todo va bien ahora, empezaremos con las surround .

Pero estoy seguro por lo que dices que no es el ampli.