Muy buenas.
Tienes buen equipo. Los Onkyo son buena marca y suelen dar buenas prestaciones (eso dices). Yo hace poco adquiri un Onkyo 601. Dicen que Onkyo tiene buena sinergia con JBL (no se que altavoces tendrás pero yo tengo unos E 80 y la verdad es que suena muy bien.

Lo del subwoofer no se contestarte, pero lo de la gestión de graves dependiendo de los altavoces que tengas tienes que escoger una frecuencia. Yo los tengo a 80 según recomendaciones del foro.
Saludos