Ya he solucionado el problema de los MKV. Bueno más o menos. Surfeando una tarde entera por nuestro querido google al final encontré una forma de ver esos "desparecidos" MKV:
Sólo se pueden ver en la opción "CARPETAS" del menú superior, en ninguna de las demás vistas aparecen esos archivos HD, pero si vas abriendo carpetas hasta llegar al archivo, al final lo encuentras. Es un problema de software que te vuelve loco: piensas que si no está en una vista por nombre, ni por fecha, ni favoritas... en las que sí figuran los divx, no estará tampoco en la última de la lista que es la vista de carpetas (bueno la verdad es que ni lo piensas).
Esperemos que los de Samsung se den cuenta de esto y no la caguen al hacer la actualización del firmware. Luego llamaré para comentárselo.
Por cierto "Home" de 8 gb se ve correcto. Cuando tenga el reproductor de Blu-ray ya lo compararé con la original (es una peli muy difícil de comprimir y se nota). No hay ningún tipo de parón que algunos reproductores multimedia HD dedicados sufren con esta peli.