Grabar blu-ray no es muy complicado. Hay dos variantes, BD normal y AVCHD. Yo suelo grabar el BD normal, contiene dos carpetas, BDMV y CERTIFICATE, que se graba en disco con sistema de ficheros UDF. Un software muy recomendable para la faena es ImgBurn, gratuito y con foro de soporte. Es todo bastante intuitivo, con un BD regrabable a mano lo aprenderás enseguida.
Si la cámara no crea carpetas con la estructura BD o AVCHD, puedes recopilar con otro programa gratuito y tan sencillo como potente: tsMuXeR. No lo he probado para 3D, pero debería funcionar.
Edito: Olvidé que porlo menos algunos discos 3D contiene una tercera carpeta, ahí no valdrá tsMuXeR.