Subtitulos duplicados en Samsung 6030 con MKV

Buenos dias, tengo un problema y no encuentro la forma de solucionarlo.
Tengo un televisor Samsung 6030 (que me permite visualizar 3D SBS), he bajado varias peliculas en MKV, por ejemplo "Valiente", con el MKVMerge he podido establecer que se escuche en ingles y que se muestren los subtitulos.

El problema surgió cuando quise hacer lo mismo con otras peliculas, cuando empiezo a reproducir la pelicula se ven las 2 pantallas (izquierda y derecha cada una con los subtitulos), hasta ahora todo normal, entonces apreto el boton para activar el 3D y la imagen se ve correctamente (se unen ambas pantallas y se ve una sola con la profundidad y el efecto 3D correcto) pero los subtitulos aparecen duplicados, siguen apareciendo cada uno en su lado de la pantalla, como si el SBS se hubiese activado para la imagen pero no para los subtitulos.

¿A alguno le ha pasado? ¿Podrian ayudarme por favor?
Desde ya muchisimas gracias por su ayuda, ya no se que probar.