Me parece magnífica opción el J1900 y el J2900 (más moderno aun), consumen realmente poco y van excelentemente bien, hace poco monté un J1900 y una maravilla.
Respecto a caja y fuente... pues en mi opinión, puedes optar por las versiones "DC" de Asrock que incluyen un conector para fuente externa como la de los portátiles, en amazon puedes comprar una fuente pasiva por 19€ perfecta para este uso:
Delta ordenador portátil de alimentación de CA Adaptador de cargador 19V 4,74A 90W para Asus X53S X56 X56VR: Amazon.es: Electrónica
y así comprar una caja que sea para fuentes "normales" como la Silverstone ML03 y ML04 y aprovechas el espacio donde iba la fuente para poner discos. Claro que tienes que ser algo mañoso para hacerte un soporte para los discos y tapar de forma "elegante" el hueco que se queda donde la fuente. Claro que estas cajas ya de por si soportan 2 HDD, lo otro sería por si quieres en un futuro poner más, con lo que también podrías optar por una de estas cajas con una fuente ATX tipo Be Quiet de 300W que salen bien de precio... ya valora las opciones.
También, con ese tipo de configuración (placa con PicoPSU integrada + fuente pasiva externa) puedes poner una caja de menores dimensiones todavía... lo malo es encontrarla con 2 bahías para discos de 3.5".
Saludos.