Si pasas la señal al sub por LFE, el crossover no afecta lo más mínimo. Esa ruleta está para cuando mandas una señal completa sin filtrar (especialmente al hacer la conexión por alta - cables de altavoces).
De todas maneras, si aplicamos la lógica encontraremos la solución por nosotros mismos...
Si tienes el crossover a 150Hz, pasas el YPAO y te deja el filtro en el AVR a 120Hz, podemos concluir que como la señal ya está por debajo de los 150Hz de la ruleta sub, ésta no se verá afectada nunca. Vamos, que la puedes dejar al máximo siempre.