Son dos conceptos muy diferentes. A priori, me atrevo a decir que el conjunto Pioneer, a pesar de ser básico, dará más calidad y sobre todo potencia.
Los altavoces Logitech son eso: unos altavoces. No cuentan con entradas digitales, por lo que si un día quieres conectar un BluRay, una consola, etc, sólo podrás hacerlo por estéreo en el mejor de los casos, tirando todo el efecto multicanal.
En cambio, un receptor+altavoces te da mucho más juego de conexiones y siempre se pueden cambiar los altavoces en el futuro manteniendo el receptor. Eso sí, ese Pioneer precisamente no es el mejor para esto puesto que no cuenta con salida de previo de sub (para subs activos, que son la mayoría de los que se venden).
Todo depende de lo que quieras o necesites.