La shield en la configuración del hdmi viene con 3 opciones (y está actualizada a la última porque no me deja actualizar más y la versión de android es la 5.1)
Son 1080 60 hz (recomendado ) que es la que viene por defecto.
1080 50 hz
y 1080 23, 9476.
No hay nada que ponga auto.
En netflix .. por lo menos en el programa que te instala la shield en configuración no deja configurar absolutamente nada.
Si antes has puesto 60, lo ves todo a 60 y si has puesto 24 pues 24... no hay tutía...
en cuanto a Kodi .. pues ni idea tampoco lo veo...