Bueno, yo en el HTPC tengo una Asus Strixx GTX960 y los ventiladores están parados, así que silenciosa es. Si quieres meterle algún juego yo iría por la RX470 cuando salgan los diseños AIB, el diseño de referencia sí debe ser algo ruidoso, pero teniendo 110W y con un disipador en condiciones no debería hacer ruido ...
Respecto al micro, la verdad es que ahora mismo soy parcial, a mí me gusta siempre burro grande, y en este caso creo que Intel se lleva la palma. Comprando más con cabeza seguro que te recomiendan los AMD ... pero yo el último que tuve fue un Toledo X2 4400, qué tiempos aquellos.
Las APU AMD son mejor opción por mejor gráfica integrada, pero si piensas meterle algún juego entonces, dependiendo del juego, deberías ir a por dedicada. Y si la gráfica integrada ya no aporta, pues yo me decanto por Intel.

Saludos.