Qué raro me parece que solo puedas seleccionar 2.0 o 5.0. En todos los receptores lo que se hace es conectar los altavoces a las tomas de la ubicación deseada (frontal, trasero, central, etc.) y cuando se pasa la herramienta de calibración (YPAO en Yamaha), el receptor detecta los conectados y desactiva los canales desconectados.
Yo tengo un receptor RX-V750 bastante más antiguo que el tuyo, y venía con YPAO. El tuyo también lo tiene que tener.