Efectivamente se debe al cambio de capa. En los mismos DVD te lo advierten por detrás.
Pero es cierto que este es insignificante. Suelen hacerlo en un cambio de escena o fundido a negro.
Si lo notas, y de 1 segundo se deberá más al reproductor.
De los DVD que he visto hasta la fecha (y son bastantes) tan sólo recuerdo en una peli donde se notaba. Y es que venía el cambio de capa en un travelling.