Canopus

Una vez tienes la peli en la carpeta "Source" le das al boton "Advanced", el "Total frames" lo divides por 2 y la cantidad la colocas en "Current Frames" y pulsas "Out", ya puedes hacer el "Convert" (guarda el archivo, ejemplo Matrix 1). Para hacer la segunda parte, en "Current Frames" la cantidad anterior y pulsas "In"; otra vez en "Current Frames" el total de frames y pulsas "Out", y "Convert (Matrix 2)
Ya verás como la barra hace la mitad cada vez.

Yo me he encontrado con problemas de sincronización con el audio en la segunda mitad...y chungo para arreglarlo. Yo lo hize con el programa de edición de video, pero este ya es otro tema.

También puedes utilizar el VirtualDub y TMPGEnc, mas laborioso de utilizar pero no da tantos problemas de sincronización.

Una vez cargada la peli, en la pestaña "Source" pulsas "Advanced", coges la cantidad de "Total Frames" lo divides por 2 o mas.

En "Current Frames" pones el resultado de la división y pulsas "Out". Ya tienes el primer trozo preparado,en "Target" escoges el tipo de compresión y le das un nombre (ejemplo Matrix 1) ahora a "Convert".
Para el siguiente trozo en "Source" "Current Frames" la cantidad anterior y pulsas "In", otra vez en "Current Source" la cantidad total o la suma de las dos primeras, y pulsas "Out" verás como la barra se mueve de acuerdo con los trozos seleccionados, y "Convert" ( Matrix 2).

En la segunda parte puede dar problemas de sincronización con el audio.... chungo!!, yo lo arreglé con un programa de edición de vídeo, pero este ya es otro tema.

Puedes utilizar también los programas VirtualDub + TMPGEnc, son mas complicados para hacer lo mismo pero quizá no dan los problemas de sincronización.

Espero que te sirva.