He leído que en discos muy cargados de música (archivos pequeños y que pueden ser muchos miles) se puede tirar 15 minutos escaneando el disco.
Yo tengo un Lacie de 1 TB, en el que habrá entre 1000 y 2000 archivos y le lleva algo más de un minuto. De todas formas sabes que ha aceptado el disco porque aparece un mensaje en la parte superior de la pantalla que pone "Scanning USB disk".
¿Has probado en los dos puertos USB? Prueba a enviar un correo a WD comentándoles el modelo de disco duro, a ver si tienen constancia de alguna incompatibilidad. O a lo mejor el disco duro tiene algún problema, sectores defectuosos o similar. Prueba a hacerle un scandisk.
Saludos.